1949年杭州解放后,蔡堡任浙江醫(yī)學(xué)院(今浙江大學(xué))教授,主講米丘林學(xué)說和巴甫洛夫?qū)W說。他在浙醫(yī)大任教直到1986年90歲高齡。
1958年,西湖水色突然變紅,蔡堡受命進(jìn)行生態(tài)研究,作出藍(lán)藻作祟的判斷,采用螺螄滅藻的方法,次年,就使湖水變清。他畢生從事教育和科學(xué)事業(yè),研究蠑螈生活史近30年,1978年出版《東方蠑螈胚胎發(fā)育圖譜》,填補(bǔ)了生物學(xué)的一項(xiàng)空白。還撰寫大量關(guān)于動(dòng)物胚胎、蠶體遺傳等學(xué)術(shù)論文,受到生物學(xué)界稱譽(yù)。生平治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),教學(xué)認(rèn)真,桃李遍天下,其中不乏第一流人才。著名生物學(xué)家童第周,是蔡堡在復(fù)旦大學(xué)任教時(shí)的學(xué)生。1927年秋,聘為蔡的胚胎學(xué)助教。蔡堡多次參加主編全國(guó)醫(yī)藥院!渡飳W(xué)》、《生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》教材。1977年,已年屆八十,重上講臺(tái),講授遺傳學(xué)。
蔡堡為民主同盟盟員,熱愛祖國(guó),熱愛共產(chǎn)黨。1951年起,歷任浙江省政協(xié)委員、常委,第四、五屆省政協(xié)副主席,第三、四、五屆全國(guó)政協(xié)委員,省科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)副主席、顧問,中國(guó)動(dòng)物學(xué)會(huì)名譽(yù)理事,浙江省動(dòng)物學(xué)會(huì)名譽(yù)理事長(zhǎng)。與中國(guó)共產(chǎn)黨共事中,勇于發(fā)表己見,被譽(yù)為“黨的諍友”。多次被評(píng)為全國(guó)、省、市先進(jìn)工作者。在科技、教育界德高望重。蔡堡亦精于詩詞,工作之余,常作詩自娛,留有《詩集》手稿。